入金管理は取引先や顧客からの入金状況を正確に把握し、入金予定などを管理することで資金繰りの安定にもつながる重要な業務の一つです。しかし、その業務の煩雑さから入金漏れの発生や消込漏れなどのミスが頻発するケースも存在します。そのような入金管理業務を効率的に管理する方法の一つが「入金管理システム」の活用です。
本記事では、おすすめの入金管理システムを10製品ご紹介します。導入するメリットや選び方のポイントなども解説しているので、ぜひ最後までご覧ください。
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2025年12月22日公開
入金管理は取引先や顧客からの入金状況を正確に把握し、入金予定などを管理することで資金繰りの安定にもつながる重要な業務の一つです。しかし、その業務の煩雑さから入金漏れの発生や消込漏れなどのミスが頻発するケースも存在します。そのような入金管理業務を効率的に管理する方法の一つが「入金管理システム」の活用です。
本記事では、おすすめの入金管理システムを10製品ご紹介します。導入するメリットや選び方のポイントなども解説しているので、ぜひ最後までご覧ください。
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目次
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入金管理とは、企業が提供した商品やサービスの代金が、顧客や取引先から正しく支払われているかを確認し、記録・照合・回収などを行う経理業務のことです。
具体的には、「債権の発生」「請求内容の確認」「入金予定の把握」「売掛金との照合」「未入金への対応」「入金消込」などが主な業務として挙げられます。これらの業務を適切に行うことで、資金繰りの安定や取引先との良好な信頼関係の構築などにつながります。
しかし、入金管理業務は、業務フローが煩雑化・属人化しやすい傾向にあります。Excelや手作業による管理には限界があり、入金管理システムをはじめとしたツールを導入し、業務の効率化・省力化を図ることが、健全な業務環境の構築のために重要です。
入金管理システムとは、企業の入金状況を正確に把握し、効率的に管理するためのツールのことです。未入金の確認や入金消込といった作業を効率化できるため、経理担当者の業務負担を大幅に軽減することができます。さらに入金予定を可視化できるようになることで、資金繰りの計画や経営判断にも役立てられます。

また、入金管理システムにはさまざまな種類があるのが特徴です。例えば「入金管理機能を備えた販売管理システム」や「入金消込から債権管理までをカバーする請求管理システム」、「入金消込機能を搭載した請求書発行システム」、さらに「入金消込業務に特化したシステム」などがあります。なお、入金管理システムの定義や分類は企業によって異なる傾向にあるため、自社の要件に応じてどの業務範囲をカバーすべきかという精査が必要です。
入金管理業務は、企業の資金の流れを正確に把握するうえで欠かせない業務ですが、実際には非常に複雑で手間のかかる作業です。膨大な入金データの消込処理や、未入金が発生した際の確認・対応など、多くの時間と労力を要します。
また、入金管理は正確性・専門性を求められる業務であるため、担当者が限定されやすい傾向があります。特にExcelなどで独自のフォーマットを用いて管理している場合は、担当者以外が内容を把握しづらく、属人化のリスクが高まります。
さらに目視確認や手作業による処理では、転記ミスや消込漏れなどの人的ミスが発生する可能性も懸念されるでしょう。こうした課題を解決し、業務の正確性と効率性を高めるためには、入金管理を効率化できる入金管理システムの導入が非常に有効です。
入金管理システムに搭載されている機能は、製品によって細かく異なります。一般的には以下のような機能が備わっており、入金状況の把握から債権管理、未入金対応までを一元的に行える製品が多いです。搭載されている機能は製品によって異なりますが、一例をご紹介します。
| 機能名 | 内容 |
|---|---|
| 入金データの取得 | 入金データを自動的に反映する機能。銀行口座や決済サービスと連携させることで、入金状況をリアルタイムで確認できる |
| 請求データとの照合 | 入金データと売掛金データを照合する機能 |
| 入金消込機能および管理 | 入金と請求データの消込を自動化し、消込状況を一覧で管理できる機能 |
| 債権管理機能 | 売掛金の残高管理や回収状況を可視化し、一元管理する機能 |
| 各ステータスの自動更新 | 入金処理の進捗(しんちょく)に応じて、入金済・未入金・遅延などのステータスを自動更新する機能 |
| 取引先情報の管理 | 支払条件、入金履歴、未入金リストなどの取引先情報を管理する機能 |
| アラート・自動通知機能 | 未入金や入金遅延が発生した際にアラートや通知を自動で送信する機能 |
| レポート作成機能 | 入金率や未回収状況などのデータを分析し、レポートとして出力できる機能 |
入金管理システムを導入するメリットは、以下のような点が挙げられます。
ここでは、それぞれのメリットについて解説します。

入金管理システムを導入することで、システム上で入金データや請求情報などを一元管理できるため、それまで手作業で行っていた一連の業務をスムーズに進められます。
例えば、煩雑な入金消込や照合作業を自動化することで、処理スピードの向上が期待できます。また、入金データの中の「振込名義人」と得意先のひも付け設定ができるため、確認作業も迅速に行うことが可能になるでしょう。
こうした業務効率化により従業員の負担が軽減されれば、生産性が向上するだけでなく、他の重要業務に注力できる時間を確保できる点も大きなメリットです。
入金管理業務を手作業やExcelなどで行っている場合、どうしても人的ミスが発生しやすくなります。しかし、入金管理システムを導入して一連の業務を効率化・自動化することで、こうしたヒューマンエラーを大幅に削減することが可能です。
例えば、入力ミスや入金回収漏れなどは、顧客との信頼関係に直接影響する可能性があります。システムを活用することで、こうしたリスクに対して有効な対策を講じることができるのは大きなメリットだといえるでしょう。
入金管理業務を担当者の独自の方法で行っている場合、業務が属人化しやすくなります。しかし、入金管理システムを導入すれば、入金確認から消込、未入金対応までの一連の業務を標準化することが可能です。
仮に担当者の不在や離職、人事異動などが発生しても、入金確認業務を滞らせることなく継続して遂行できるため、企業全体の安定的な管理体制を構築しやすくなるでしょう。
入金管理システムは、会計ソフトや販売管理システムなど他のシステムと連携させることも可能です。他システムと連携することで、入金データと売掛金の残高情報、売上に対する未入金分の付け合わせなどの整合性を保ちながら一元管理することができます。
例えば、各システム間でその都度データを転記したり、チェックしたりする作業を減らせるため、転記ミスなどの削減・幅広い業務の効率化につながります。
入金管理システムを導入することで、入金処理の履歴管理やアクセス制限などを適切に設定でき、業務の透明性と信頼性を高めることが可能です。
これらの管理および制限は、内部統制の強化や監査対応の強化にもつながり、コンプライアンス面でも安心して運用できる体制を構築できます。
前述したように、入金管理システムにはさまざまなタイプがあり、カバーできる業務範囲が異なります。自社に適した入金管理システムを選ぶためには、以下のようなポイントを意識することが大切です。
ここでは、それぞれの選び方のポイントについて解説します。

入金管理システムを導入しても、自社の課題を十分に解消できなければ、導入効果は限定的になってしまいます。そのため、まずは自社の管理業務における課題を明確にし、導入目的を定めることが重要です。そのうえで、課題解消につながる機能を搭載した製品を選定するとよいでしょう。
例えば、入金消込の照合率が低い場合であれば、照合精度を高める機能が充実したシステムが選択肢として有効です。一方、入金消込に加えて債権管理も効率化したい場合であれば、売掛金や請求データとの付け合わせまで行えるシステムが候補として適切でしょう。
このように、自社のニーズに合った機能を優先的に確認することが、システム導入成功のポイントです。
入金管理システムと一口に言っても、製品によってシステムタイプや対応業務は大きく異なります。例えば、入金消込から債権管理までカバーするシステムや、販売管理システムに入金管理機能(回収管理や債権管理)が内包されているシステムなどがあります。
そのため、導入の目的や自社の課題に応じて、適切なタイプを選ぶことが重要です。具体例としては「入金管理自体に課題がある場合は、入金管理システム単体で導入する」「販売プロセス全体を効率化したい場合は、入金管理機能を搭載した販売管理システムを導入する」などが考えられるでしょう。
特に後者の販売管理システムは、入金管理だけでなく、見積から受注・売上、請求・入金までの業務フロー全体として効率化できる点が大きなメリットです。
入金管理システムを導入する際は、既存のシステムと連携できるかどうかも重要なポイントです。既存システムとの連携ができない場合、システムの効果を十分に享受できない可能性があります。
もしも会計システムや顧客管理ソフトなどを既に利用しているのであれば、それらとスムーズに連携できる製品を選ぶことが望ましいです。連携可能なシステムの豊富さや、連携方法などを確認するとよいでしょう。具体的には、システム間で自動的にデータを連携する「API連携」や、CSVファイルを介してデータを共有する「CSVファイル連携」の有無などを確認しておくと安心です。
入金管理システムを選ぶ際は、システムの機能だけでなく、ベンダーから受けられるサポート体制も重要なポイントです。
導入前であれば、自社の業務課題を丁寧にヒアリングしてくれるか、適切な提案を行ってくれるかを確認しましょう。導入後であれば、システムの保守・メンテナンス対応や、不具合やトラブル時の迅速な対応が可能か、さらに訪問・電話・メール・リモートなど、対応方法の選択肢が豊富かどうかを具体的に確認すると安心です。
入金管理業務は、企業の売上資金の回収にかかわる重要な業務です。システム導入の検討する際は慎重に運用の設計をしなければ、システム活用が定着化せず導入効果を得られなくなってしまいます。そのため、自社の業務フローへの理解や課題傾向を熟知しているベンダーから、課題解決に向けた運用方法まで適切に提案してもらえるかが重要です。システムを選ぶ際も、価格やUIといった表面的な特徴だけで判断するのではなく、ベンダーの経験やノウハウ、業務への理解なども判断材料にするとよいでしょう。
専門知識や実績が豊富なベンダーを探す際には、Webサイトを参照し、自社と同様の業種業界における課題解決の事例があるか事前に確認しておくと安心です。
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ここからは、おすすめの入金管理システムを10製品ご紹介します。それぞれの製品の概要や特長をまとめていますので、システム選びの参考にお役立てください。
「SMILE 販売」は、入金管理機能のみならず、見積から受注・売上・請求、仕入や買掛・在庫管理に至るまで販売フロー全体をカバーするオールインワンの販売管理システムです。マスターや伝票への独自の項目の追加や、各種実績の集計・オリジナル帳票の作成・多角的なデータ分析などが行えます。ここでは、入金管理業務を効率化し、担当者の負荷を軽減する便利な機能を一部ご紹介します。
CSVファイル・テキストファイル・Excelファイルの入金明細データを取り込み、内容を自動で判断し、伝票作成することが可能です。転記作業をなくし、伝票入力業務の効率化を実現します。
請求漏れを防ぐための請求先の自動抽出や、入金伝票の入力と同時に回収の消込を行うことができ、未回収のチェックを正確に行えます。
「Ally」は、請求書発行のタイミングの管理と売上計上基準の両方を満たした販売管理システムです。「契約情報と売上データの突合が手間」「部門別・契約別の収益状況が見えない」といったさまざまな課題解決に役立つ機能を多数備えています。
入金管理に関する機能としては、「請求データ一括作成」「入金一括入力」「入金自動消込」などが行える債権管理機能を利用可能。さらに会計システムとの連携にも対応しており、一連の流れで会計計上までを仕組み化できる点も魅力です。
「請求管理ロボ」は、請求書の発行・送付、集金、消込、催促など、入金管理を含む業務を効率化・自動化する請求管理システムです。特に飲食店や不動産業界が抱えやすい「入金遅延」や「煩雑な小口債権管理」といった課題解決に役立ちます。
入金管理に関する機能としては、金融機関と連動し自動で入金消込を行う「自動入金消込機能」が搭載、銀行振込消込やクレジットカード消込など、多彩な決済手段に対応可能。入金状況を随時確認できる機能も搭載されており、入金の経路を問わず、任意のタイミングで入金状況を可視化できます。
「楽々クラウド決済サービス」は、請求する料金の計算から回収までの自動化をサポートする請求管理システムです。一般法人のほか、自治体・学校での利用も想定されており、それぞれに対応した機能が搭載されています。
主な機能としては、毎月の請求額計算、金融機関へのデータ送付、請求書の印刷・封入などを自動化する機能を利用可能。そのほか請求ごとの収納状況の一覧確認、口座振替ができなかった場合の請求書自動送付などにも対応しています。
「MakeLeaps」は、インボイス制度・電子帳簿保存法にも対応したクラウド型見積・請求・入金管理システムです。クラウド上での各種書類作成・送付、入金管理、申請・承認などが行え、入金管理をはじめとした一連の請求業務を効率化できます。
入金管理に関する機能としては、銀行口座の入金情報を連携する「口座連携」や、クレジットカード決済に対応することによる「入金消込作業の自動化」、売上金や売掛金を表・グラフで分析する「売上レポート」などを利用可能。また、オプションでは外部システムとの連携も提供しているため、システムの柔軟性にも富んでいます。
「Bill One債権管理」は、バーチャル口座の割り当てから入金消込までの幅広い業務の自動化を支援する債権管理システムです。債権や入金に関する対応を一元管理できるようになり、アナログな請求書発行業務、非効率な入金消込作業などにおける課題を解決に導きます。
入金管理に関しては、登録した請求先ごとに固有のバーチャル口座番号を割り当て、管理することが可能。確実に入金元が特定できるようになることで、複数の請求分を一括した合算入金や入金消込の自動化などを実現します。そのほか、債権・入金情報の一元管理、入金状況のリアルタイム確認などにも対応可能な点も魅力です。
「V-ONEクラウド」は、入金消込作業に特化した入金管理システムです。1クリックでの入金消込をうたっており、属人化の解消・大幅な業務効率化をサポートします。また、販売管理システム、会計システムなどと連携することで、債権管理業務全体を効率化できる点も魅力です。
主な機能としては、面倒な入金消込をAI(機械学習)が瞬時に照合する「一括入金消込機能」や、入金額と一致する請求明細の組み合わせを自動で検出する「消込シミュレーション機能」などを搭載。そのほか「入金データ自動連携」「債権管理帳票機能」など、幅広い機能を利用できます。
「債権奉行iクラウド」は、入金照合・消込の時間削減と確実な債権回収を実現する債権管理システムです。入金消込を自動化し、従来のExcelによる手作業負荷を軽減。さらに滞留債権管理・督促といった債権回収を強化するための機能も備わっています。
主に「入金消込・入金管理」「請求・回収予定管理」「債権管理帳票」などに関する機能を標準搭載。入金情報管理・入金消込、回収サイト管理・与信管理、定型帳票・分析帳票など、基本的な業務を自動化・省力化するための機能を利用できます。そのほか、拡張オプションや同ベンダーが提供する製品との連携も可能なため、幅広い業務を効率化するための拡張性・柔軟性にも優れています。
「バクラク債権管理」は、AIが自動で入金消込を行い、債権管理業務の効率化を支援する債権管理システムです。各種帳票の請求データを連携し、請求・仕訳・督促の全プロセスのスムーズな進行をサポートします。煩雑な入金確認および消込作業の負担軽減、督促業務の工数負担・回収漏れリスクの軽減に寄与するでしょう。
主な機能としては、複数の入金と請求情報を自動でマッチングする「自動照合・一括消込」、入金や消込のタイミングで仕訳を自動作成する「入金消込仕訳作成」などを搭載。会計ソフトに合わせたCSV出力やAPI連携も可能なため、より広範な業務における効率化も期待できます。
「invox発行請求書」は、請求書の作成・発行から入金消込までの自動化をサポートする請求書発行システムです。インボイス制度に対応した請求書を発行し、売上計上や入金消込・督促までを仕組み化することができます。
主な機能としては、「請求データの取込」「請求書の発行・売上計上」「入金消込・督促」「会計システムとの連携」が利用可能。柔軟な仕訳生成と承認ワークフロー機能も備わっているほか、情報セキュリティマネジメントの認証基準「JIS Q 27001:2025(ISO/IEC 27001:2022+Amd 1:2024)」を取得しているセキュリティ体制も魅力です。
入金管理システムは、企業の入金状況を正確に把握し、未入金確認や入金消込などの業務を効率化するツールです。経理担当者の負担を軽減し、資金繰りや経営判断に役立ちます。
入金管理業務は膨大で複雑なため、手作業では人的ミスや属人化のリスクが高く、担当者不足にも陥りやすいです。こうした課題を解決するためにも、業務の正確性と効率性を高める入金管理システムの導入が有効でしょう。
しかし、入金管理システムには「入金管理機能を有した販売管理システム」「入金消込から債権管理までをカバーする請求管理システム」など複数の種類が存在します。そのため、自社の現状や環境、課題などを丁寧に洗い出し、自社に合った製品を的確に選ぶことが求められます。
入金管理システムの導入を検討中の場合は、ぜひ本記事でご紹介した製品をはじめ、複数の製品を比較検討し、自社に合った製品を見つけてみてください。
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